Aflevering 5: Expertkennis vertaald in formules
Het is belangrijk om borstkanker zo vroeg mogelijk te ontdekken. Toch gebeurt dat niet altijd, radiologen zien een kwart van de tumoren op mammogrammen over het hoofd. Nijmeegse onderzoekers willen daarom de bestaande detectiesoftware verbeteren. Ook willen ze de expertkennis van ervaren radiologen formaliseren en in de software verwerken.
Is Nederland innovatief bezig?
Peter Lucas: "In dit project willen wij de kennis van radiologen verwerken in onze zogeheten Computer Aided Detection-software."
U hebt in juli 2006 zo’n 400.000 euro ontvangen van NWO. Wat gaat u met dat geld doen?
Lucas: "Die vier ton zijn een grove schatting van het salaris dat we nodig hebben om twee fulltime postdocs en één parttime programmeur voor de duur van drie jaar aan te nemen."Hoeveel draagt de nu verstrekte subsidie bij aan dit onderzoeksproject?
Lucas: "Deze subsidie ís dit project. Waarmee ik natuurlijk niet wil zeggen dat er zonder deze subsidie in Nijmegen geen onderzoek meer naar borstkanker wordt gedaan, maar alleen dat onze insteek niet zou zijn gebruikt."Wat houdt die insteek in?
Lucas: "Radiologen worden in hun werk ondersteund door beeldverwerkingsoftware die verdachte plekken aanwijst op röntgenfoto's van borstweefsel. Mijn collega Nico Karssemeijer van de radiologieafdeling van het Universitair Medisch Centrum St Radboud houdt zich binnen dit project onder andere bezig met het verder verfijnen van deze Computer Aided Detection (CAD)-software. Maar dat is niet genoeg. Voor een goede borstkankerscreening is expertkennis onontbeerlijk."
"Een mammogram is een verzameling witte en zwarte vlekken. Je zou denken dat het leren herkennen van tumoren op basis van grote hoeveelheden beelddata een ideale taak is om te automatiseren. Maar toch zijn ervaren radiologen nog steeds beter in het ontdekken van borsttumoren dan computers. Ze bezitten blijkbaar expertkennis die onontbeerlijk is voor de exacte interpretatie van vlekken op mammogrammen. Het CAD-systeem kan daar niet aan tippen, zelfs niet als de software verbeterd wordt door de software beter te trainen met meer data. In een vooronderzoek samen met Perry Groot hebben we dit aangetoond."
"In dit project willen we de expertkennis van radiologen daarom achterhalen en verwerken in deCAD-software. We vragen hen te beschrijven hoe zij tot hun beslissingen komen. Ook moeten ze ons vertellen op welke punten CAD-software volgens hen te kort schiet. Daarnaast willen we weten welke extra variabelen radiologen en artsen gebruiken om de digitale beelden beter te kunnen interpreteren. Die expertkennis willen we formaliseren en opnemen in de probabilistische modellen die we gebruiken om te voorspellen of er wel of geen tumor te zien is op een mammogram. In onze software willen we statistische modellen (gebaseerd op grote aantallen beelden) combineren met methoden voor kennisrepresentatie (gebaseerd op expertkennis)."
"Voor die combinatie zijn Bayesiaanse netwerken heel geschikt. Die zien er op het eerste gezicht simpel uit - een verzameling variabelen die door pijlen van een bepaalde sterkte met elkaar verbonden zijn - maar er zit behoorlijk geavanceerde wiskunde achter. In de loop van het onderzoek gaan we bepalen hoe we de expertkennis het best kunnen representeren. Het is nog de vraag of we moeten kiezen voor een logische, semantische of objectgeoriënteerde beschrijving."
"Het probleem bij een logische beschrijving op grond van zogeheten Horn-clauses, is dat die tot nu toe alleen geschikt zijn voor kansverdelingen op basis van discrete variabelen. Terwijl veel variabelen die wijzen op de aanwezigheid van tumoren - zoals een hoge dichtheid van het borstweefsel - juist continu zijn. Dat is de centrale vraag in veel van mijn onderzoek - hoe je greep kan krijgen op kwalitatieve medische kennis door die vast te leggen op een formele manier."
Hoe praktisch toepasbaar is uw project?
Lucas: "Als we erin slagen om de interpretatie van mammogrammen te verbeteren, is het maatschappelijk nut daarvan evident."
[Beeld: Peter Pakvis]
Het onderzoek Bayesian Decision Support for Medical Screening van dr. Peter Lucas behoort tot het programma BRICKS/FOCUS. Via dit onderzoeksprogramma BRICKS/FOCUS wil NWO talentvolle informatica-onderzoekers scouten en opleiden.
09-02 'Ook met cookiewet is gebruiker niet anoniem'
07-02 Detron zoekt naar scherper profiel
07-02 De lange weg naar ERP
01-02 Imtech ICT hoort bij tien grootste dienstverleners
31-01 Infotheek profiteert van overjarige hardware
27-01 iPad is favoriet in de zakelijke markt
25-01 Recessie schrikt ICT-bedrijven niet af bij...
23-01 Boek belicht tien effecten van opkomst apps
20-01 'Oracle wil iPad van de bedrijfs-ICT worden'
19-01 Dell consolideert zijn dataopslag onder Fluid
09-02 Oracle neemt eHRM-specialist Taleo over
09-02 KPN benoemt Nederlandse directeur en CFO
09-02 MySapply koopt collectief accountantsdiensten in
08-02 Sogeti ontslaat nog eens 110 medewerkers
07-02 Verhuurder Capgemini-pand vecht verhuizing aan
06-02 Erasmus Universiteit reorganiseert ICT
06-02 Banometer: Topstart vacaturemarkt krijgt vervolg
03-02 Learningguide Solutions wijzigt naam in Ontuitive
03-02 Macaw-ontwikkelaar wordt Sharepoint-master
03-02 Capgemini verhuist medio 2013 naar Leidsche Rijn
|
|

